كانت القرية تقع في رقعة مستوية من الأرض في السهل الساحلي. وكان طريق يافا ؟ طولكرم العام يمر على بعد 2,5 كلم الى الشرق منها, كما كان خط سكة الحديد الممتد بين حيفا واللد يمر على بعد 1,5 كلم الى الشرق ويشكل الحدود بين أراضي كفر سابا وأراضي قلقيلية التي تبعد عنها 3 كلم الى الشمال الغربي. وكانت طرق فرعية مماثلة تربطها بالقرى الأخرى في المنطقة. وقد أنشئت كفر سابا على بعد 4كلم جنوبي شرقي خربة سابية (141177)التي عدت قائمة في موقع كفر سابا الرومانية وكانت القرية باسم كفرسبت أيام الصليبين.
أتى نفر من الجغرافيين والمؤرخين العرب والمسلمين الى ذكر كفر سابا فمن ذلك أن المقدسي الذي كتب في سنة 985 وصفها بأنها قرية كبيرة فيها مسجد على طريق دمشق وجاء في رواية الرحالة ناصر خسرو, الذي كتب في سنة 1047م, إن كفر سابا بلدة غنية بالتين والزيتون وتقع على طريق الرملة في سنة 1596, كانت كفر سابا قرية في ناحية بني صعب (لواء نابلس), وعدد سكانها 231 نسمة وكانت تؤدي الضرائب على عدد من الإنتاج والمستغلات كالماعز وخلايا النحل ويشهد اللقيمي, الرحالة الصوفي المصري على استمرار وجود القرية فقد كتب في سنة 1730 انه كفر سابا وشاهد مقام بنيامين (المسمى أيضا مقام النبي يمين),(الخالدي 1968 : 189).
في أواخر القرن التاسع عشر وصفت كفر سابا بأنها قرية مبنية بالحجارة والطوب على تل قليل الارتفاع وقدر عدد سكانها ب800 نسمة. كان فيها مسجد وتحف بها بقاع رملية وكانت بساتين الزيتون تشاهد شمالها وكان الى الشرق والشمال الشرقي منها بضعة ينابيع كان إحداها يمد سكان القرية بمياه الشرب. وكان شكل القرية أشبه بالمربع. وقد نمت القرية في فترة الانتداب البريطاني وامتد بناء المنازل نحو طريق طولكرم ؟ يافا العام على الأراضي الزراعية بينما كانت الأراضي الزراعية الجديدة تستغل الى الغرب من موقع القرية وكان سكان كفر سابا من المسلمين لهم فيها مقامان: النبي بمين المشار اليه سابقا ومقام أخر للنبي يحيى كما فيها مدرسة ابتدائية وكان سابقا, ومقام أخر للنبي يحيى كما كان فيها مدرسة ابتدائية وكان سكان القرية يزرعون القمح والبطيخ والخيار والخضروات في 1944\ 1945 , كان ما مجموعه 1026 دونما من أراضيها مخصصا للحمضيات والموز و4600 دونم للحبوب و 355 دونما مرويا أو مستخدما للبساتين منها 30 دونما حصة الزيتون.
إحتلال القرية وتطهيرها عرقيا
كانت كفر سابا إحدى القرى الواقعة شمالي تل أبيب في منطقة مزدحمة بالمستعمرات اليهودية. وقد ذكرت صحيفة ( نيورك تايمز) أن زعماء من كفر سابا اجتمعوا الى زعماء المستعمرات اليهودية في وقت مبكر من كانون الأول\ زعماء المستعمرات اليهودية, في وقت مبكر من كانون الأول\ ديسمبر 1947 , وان الفريقين تعهدا بالحفاظ على السلام. لكن لما كانت سياسة القيادة العامة للهاغاناه تقضي بوجوب إخلاء المنطقة من سكانها العرب قبل حلول 15 أيار \ مايو 1948 ذلك هاجمت وحدات منه القرية واحتلها في 13 أيار \ مايو جاء بحسب ما روى المؤرخ الإسرائيلي بني موريس. كما جاء في (تاريخ الهاغاناه انه نظرا الى طبيعة المنطقة(أودية وبساتين) نفذت العملية في ساعات النهار) ويدعي التاريخ الرسمي للواء الكسندروني إن المقاتلين غير النظاميين التابعين لجيش الإنقاذ العربي والمرابطين في القرية, جعلوا سكان الإنقاذ العربي تظهر أن الوحدة المكلفة الدفاع عن كفر سابا وذلك أمرت السكان بالعودة بعد هجوم سابق قامت الهاغاناه به وذلك قبل بضعة أيام فحسب وهذا خبر يعززه موريس. ويقول قائد جيش الإنقاذ فوزي القاوقجي أن هذا الهجوم (المباغت) وقع في 10 أيار \ مايو وانه صد (منذ البداية) ويعلق القاوقجي على ذلك قائلا: (أظن أن الغرض من الهجوم كان الاستطلاع واستكشاف أماكن مواقعنا وقواتنا وان الهدف كان قلقيلية وقد خلف هذا الهجوم غير المهم الذعر في صفوف سكان كفر سابا…).
في 13 مايو\ دون القاوقجي هجوما أخر وقع على محور شمالي جنوبي يتجه من طولكرم الى كفر سابا وقال أن التقدم صد بعد أن تكبدت الهاغاناه خسائر جسيمة وان القتال كان لا يزال دائرا والأرجح أن السكان فروا أو طردوا بعد الهجوم الثاني وان وصولهم الى قلقيلية أدى ؟ بدوره الى إخلاء البلدة مؤقتا.
القرية اليوم
استخدمت موقع القرية لبناء إحياء سكنية جديدة داخل منطقة صناعية باتت جزءا من مستعمرة كفار سابا. وقد سلم بعض منازل القرية القديمة من التدمير وهو يقع اليوم داخل المستعمرة ويستعمل عدد من هذه المنازل لأغراض تجارية, وقد بقي المقامان والمدرسة وحطام مقبرة القرية. وللمقامين مداخل مقنطرة وتعلوها قبتان. أما أراضي المحيطة بالقرية فيحرثها لإسرائيليون.
المغتصبات الصهيونية على اراضي القرية
كانت بلدة كفار سابا (141175) التي أسست في سنة 1903 والتي بلغ عدد سكانها نحو 5000 نسمة في سنة 1948 تقع جنوبي غربي القرية عشية الحرب. ولما كان عدد سكانها الآن 45000 نسمة تقريبا فقد امتدت لتشمل معظم أراضي القرية. كما أن مستعمرة نفي يمين (144175) المسماه تيمنا بالنبي يمين أنشئت في سنة 1949 شرقي موقع القرية. على الأراضي قلقيلية المجاورة وهي تقع على بعد نحو كيلومتر شمالي شرقي موقع القرية.